Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP3Q8IZU3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms