Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPUSD2Q8IZ73 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD2Q8IZ73 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms