Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLX4Q8IY92 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms