Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA8AQ86V59 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA8AQ86V59 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms