Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMC1Q7Z7K0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms