Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTU1Q7Z7A3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms