Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms