Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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USP34Q70CQ2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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USP34Q70CQ2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP34Q70CQ2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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USP34Q70CQ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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USP34Q70CQ2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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USP34Q70CQ2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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USP34Q70CQ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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USP34Q70CQ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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USP34Q70CQ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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USP34Q70CQ2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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USP34Q70CQ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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USP34Q70CQ2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP34Q70CQ2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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