Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms