Protein–RNA interactions for Protein: Q6X9E4

FBXW12, F-box/WD repeat-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW12Q6X9E4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXW12Q6X9E4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms