Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms