Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C16orf54Q6UWD8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms