Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN1Q6NZI2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms