Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40BQ6NWY9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms