Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF3Q5VWG9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms