Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOCADQ5VW36 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOCADQ5VW36 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms