Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EEF1A1P5Q5VTE0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P5Q5VTE0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms