Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RSPH4AQ5TD94 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RSPH4AQ5TD94 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms