Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HABP4Q5JVS0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms