Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms