Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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RAB6CQ53S08 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6CQ53S08 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RAB6CQ53S08 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RAB6CQ53S08 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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RAB6CQ53S08 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RAB6CQ53S08 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RAB6CQ53S08 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RAB6CQ53S08 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RAB6CQ53S08 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RAB6CQ53S08 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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RAB6CQ53S08 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6CQ53S08 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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