Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP21-3Q3LHN1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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