Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL40Q2TBA0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms