Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM71Q2Q1W2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms