Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C17orf58Q2M2W7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf58Q2M2W7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms