Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SWI5Q1ZZU3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms