Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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