Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME3Q16798 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ME3Q16798 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ME3Q16798 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME3Q16798 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME3Q16798 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME3Q16798 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME3Q16798 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME3Q16798 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME3Q16798 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME3Q16798 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME3Q16798 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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