Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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