Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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GABRA6Q16445 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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GABRA6Q16445 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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GABRA6Q16445 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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GABRA6Q16445 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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