Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK3Q16288 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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