Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F4Q16254 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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