Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms