Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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