Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SF3A1Q15459 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SF3A1Q15459 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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