Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms