Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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