Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms