Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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