Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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ODF1Q14990 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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