Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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ERV3-1Q14264 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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ERV3-1Q14264 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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ERV3-1Q14264 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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ERV3-1Q14264 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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ERV3-1Q14264 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERV3-1Q14264 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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ERV3-1Q14264 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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