Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFR3AQ14156 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFR3AQ14156 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFR3AQ14156 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFR3AQ14156 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFR3AQ14156 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFR3AQ14156 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms