Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC3Q14003 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC3Q14003 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC3Q14003 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms