Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
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