Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LAMB3Q13751 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMB3Q13751 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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