Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALCAMQ13740 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALCAMQ13740 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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