Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDH18Q13634 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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