Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAMK2DQ13557 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAMK2DQ13557 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAMK2DQ13557 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAMK2DQ13557 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAMK2DQ13557 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAMK2DQ13557 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAMK2DQ13557 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAMK2DQ13557 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAMK2DQ13557 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAMK2DQ13557 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms