Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKRN4PQ13434 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms