Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XRCC4Q13426 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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